По состоянию на 01.01.2023 налоговые органы сформировали по всем налогоплательщикам сальдо ЕНС. В этом сальдо не учитывались суммы переплаты, по которой прошло более 3-х лет. Эти суммы налоговиками отражали отдельно. При этом пропуск 3-летного срока не является препятствием для обращения налогоплательщика в суд за его восстановлением. Но обращение в суд такого восстановления не гарантирует.
Так случилось у Управления Судебного департамента (Камчатский край). По Акту сверки с налоговиками числилась переплата на сумму более 1 млн. руб., с момента уплаты которой прошло более 3-х лет. Управление обратилось в суд за ее взысканием, но все три инстанции отказали.
Суды выяснили, что до 01.01.2023 налоговые органы не раз представляли Управлению Справки о расчетах с бюджетом, соответственно, Управление не могло не знать о переплате. Внутренние организационные вопросы, касающиеся смены кадрового состава, технический или программный сбой, не влияют на определение момента исчисления срока для возврата излишне уплаченного налога. Не было и оснований перерыва срока подачи заявления о возврате переплаты.
Никакой скидки на статус Управления Судебного департамента суды не сделали, поскольку законодатель не дифференцировал регулирование возврата налоговой переплаты исходя из специфики организационно-правовой формы налогоплательщика. Порядок возврата налогов из бюджета для коммерческих и некоммерческих организаций единый.
Постановление АС Дальневосточного округа от 13.08.2025 N Ф03-2521/2025