Налоговая база по НДС при передаче имущественных прав считается в особом порядке, который установлен ст.155 НК РФ. В п.3 этой статьи указано, что при передаче имущественных прав, в том числе участниками долевого строительства, на жилые дома или жилые помещения, доли в жилых домах или жилых помещениях, гаражи или машино-места налоговая база определяется как разница между стоимостью передачи и расходами на приобретение указанных прав. Для нежилых помещений отдельных норм нет.
Однако Минфин согласился с подходом ВАС РФ о том, что при передаче имущественных прав на нежилые помещения налоговую базу по НДС следует исчислять в том же порядке. ВАС РФ указывал, что имущественные права на недвижимое имущество и на имущество, перечисленное в п.3 ст.155 НК РФ, отнесены к одному виду объектов гражданских прав и их правовой режим применительно к вопросам исчисления НДС должен определяться одинаково, если не установлен иной порядок (Постановление Президиума ВАС РФ от 25.02.2010 N 13640/09). Следовательно, при реализации имущественных прав на нежилые помещения НДС следует исчислять с разницы между ценой реализации имущественных прав с учетом налога и ценой их приобретения.
К такому же подходу ранее приходила и ФНС (см. Письмо ФНС от 27.06.2014 N ГД-4-3/12291), но Минфин был против, несмотря на то, что разъяснения вышли после Постановления ВАС (Письмо Минфина от 28.08.2018 N 03-07-11/61127).
Подробнее о том, как посчитать НДС при передаче имущественных прав, можно узнать из Готового решения: НДС при реализации имущественных прав.
Письмо Минфина России от 03.10.2024 N 03-07-11/95743