В настоящее время пени не включаются в решение налогового органа о привлечении к ответственности за совершение налогового правонарушения (или в решение об отказе). Однако пени являются производными от основной недоимки, поэтому если суд принял обеспечительные меры в отношении решения налогового органа, то это влечет запрет совершения действий, предусмотренных таким решением не только в отношении недоимок и штрафов, но и пеней, начисленных и не погашенных на дату вынесения определения суда.
Кроме того, в НК РФ прямо указано, что со дня вынесения судом определения о принятии обеспечительных мер соответствующая сумма пеней исключается из совокупной обязанности (пп.3 п.7 ст.11.3 НК РФ). ФНС направила налоговым органам Методические рекомендации о порядке учета таких пеней. Вместе с тем стоит обратить внимание, что если на момент вынесения определения суда об обеспечительных мерах соответствующее решение налоговых органов уже было исполнено полностью или в части, то такое исполнение отмене не подлежит (Письмо ФНС России от 05.07.2023 N КЧ-4-8/8543@).
Письмо ФНС России от 13.11.2023 N КЧ-4-8/14336@
