Как заявить вычет НДС, если у аванса и отгрузки разные ставки

Компания продает товары по разным ставкам: 10% и 20%. На дату аванса точно неизвестно, какой ассортимент будет отгружен. Поэтому НДС с аванса считается по ставке 20%. Как быть с вычетом указанного НДС, если отгрузка произведена в том числе по ставке 10%?

Минфин указал, что вычет производится в размере налога, исчисленного при отгрузке товаров. Иными словами, в части товаров, отгруженных по ставке 10%, указанные 10% и принимаются к вычету. Оставшийся НДС Минфин предлагает зачесть или вернуть в порядке, установленном ст.78 НК РФ. Данный вывод ранее подтверждал и ВС (см. Определение от 21.08.2018 N 310-КГ18-11870).

С нашей стороны добавим, что для зачета (возврата) налога потребуется уточненная декларация по НДС за тот период, в котором был получен аванс, с тем чтобы уменьшить сумму налога до 10%. Следуя логике Минфина, также потребуется внести изменения в авансовые счета-фактуры. Дополнительно об учете НДС с авансов см. Готовое решение: Как продавцу учесть НДС с полученных авансов.

Письмо Минфина России от 14.11.2022 N 03-07-11/110368