Субъекты МСП приобретают у IT-организации, являющейся правообладателем ПО, лицензию на право использования этого ПО со скидкой 50%, а РФРИТ возмещает IT-организации оставшиеся 50%, то есть недополученные доходы от предоставления ПО. Минфин разъяснил, что указанное возмещение можно включить в долю доходов от IT-деятельности для целей применения пониженных взносов.
По общему правилу средства в виде субсидий, за исключением указанных в ст.251 НК РФ, признаются в составе внереализационных доходов (п.4.1 ст.271 НК РФ). Но данное правило применяется в случае, если организация является прямым получателем бюджетных средств. Если же организация получает средства в качестве недополученных доходов от организации - прямого получателя бюджетных денег в рамках договора между ними, то такие средства субсидией не являются, а признаются доходом от реализации товаров (работ, услуг), имущественных прав.
Таким образом, денежные средства, перечисляемые IT-организации от РФРИТ в качестве возмещения недополученных доходов, учитываются в необходимой доле доходов IT-организации от осуществления деятельности в области информационных технологий и в общем объеме доходов IT-организации.