Налоговые вычеты, предусмотренные п.2 ст.171 НК РФ, могут быть заявлены в налоговых периодах в пределах 3-х лет после принятия на учет товаров (работ, услуг). Но если заявить их в последнем квартале указанного трехлетнего периода, то вычетов можно лишиться.
Дело в том, что период подачи декларации по НДС не входит в указанный трехлетний период. Три года для получения вычета отсчитываются с даты принятия имущества на учет и истекают в последний день квартала, на который приходится конец данного трехлетнего срока. Поэтому если вычет заявить в последнем квартале трехлетнего срока, но декларацию подать уже после его окончания, вычет фактически заявляется за пределами трехлетнего периода. Данный подход поддерживает ВС РФ. Причем уже не первый раз (см. также Определение ВС РФ от 04.09.2018 N 308-КГ18-12631).
Поэтому, чтобы не рисковать, вычет НДС рекомендуется заявлять не в последнем, а хотя бы в предпоследнем квартале трехлетнего срока. Либо придется сдавать декларацию за последний квартал трехлетнего периода в последний день соответствующего месяца (31.03, 30.06 и т.д.).
Определение ВС РФ от 24.08.2021 N 308-ЭС21-13958