Дело в том, что если на момент продажи автомобиля ИП уже утратил свой статус, он не является налогоплательщиком НДС, поскольку по правилам ст.143 НК РФ обычные физлица не признаются налогоплательщиками НДС. При этом не имеет значения "прошлое" автомобиля, в частности, использовался он в предпринимательской деятельности или нет.
А вот НДФЛ заплатить придется, но только если автомобиль продается ранее трехлетнего срока владения. Если же с даты приобретения авто прошло более трех лет, доходы освобождаются от НДФЛ. Соответствующие поправки в п.17.1 ст.217 НК РФ действуют с 01.01.2019.
Письмо Минфина России от 03.08.2020 N 03-04-05/67844