Организацию проверила ФНС и доначислила НДС, указав на незаконность применения нулевой ставки. Поскольку налог не предъявлялся контрагенту, а был уплачен из собственных средств, организация включила доначисленную сумму НДС в расходы по налогу на прибыль. Инспекция с этим не согласилась и начислила более 64 млн.руб. налога на прибыль. Арбитражный и апелляционный суды поддержали налоговиков.
Однако в кассации налогоплательщику удалось отстоять свою позицию. АС Северо-Кавказского округа отметил, что доначисленный НДС организация не предъявляла контрагенту, а уплатила за счет собственных средств. Значит, суммы относятся к прочим расходам.
Суд учел позицию Президиума ВАС РФ (Постановление от 09.04.2013 N 15047/12) по схожим ситуациям: налогоплательщики, которые не могут подтвердить нулевую ставку НДС, вынуждены платить налог, не предъявляя его контрагентам - судьи считают, что такой НДС можно учесть в расходах.
Таким образом, если подтвердить нулевую налоговую ставку не удалось, и компания готова отстаивать свои права в суде, суммы доначисленного контролерами НДС можно учесть с в составе расходов по налогу на прибыль.
Постановление АС Северо-Кавказского округа от 03.10.2019 по делу N А32-870/2019